La génétique & phases

La génétique

Avant propos

Avant toutes choses, je tiens à apporter quelques précisions sur l article ci-dessous. Tout d abord, je me base sur mes propres connaissances, acquises au cours de ces dernières années durant lesquelles je me suis intéressé a la génétique des phases, plus particulierement chez Eublepharis macularius, ainsi que sur mon cours de génétique de rhéto, très bien présenté. J ai simplifié les différentes notions autant que possible, en les réduisant a ce qui nous intéresse : l application de la génétique a la terrariophilie. La plupart des notions restent vraies pour tous les êtres vivants, mais sachez qu il existe des différences entre la génétique du règne animal et du règne végétal, ainsi que certaines autres notions utiles a la compréhension de la génétique des végétaux.
Vous comprendrez donc qu je n aborderais pas ici l histoire de la génétique, celle-ci ayant débuté grâce a monsieur Gregor Mendel, qui pu établir les lois fondamentales et les fondements de la génétique actuelle en travaillant sur les croisements de différentes variétés de pois (Pisum sativum).
Je vais tenter d expliquer de façon claire, et bien entendu simplifiée, la transmission des différents gènes responsables des phases en terrariophilie, afin de présenter un outil utile, autant pour les personnes qui débutent que pour celles qui sont déjà calées dans cette matiere.


Quelques notions importantes

Tout d abord, je pense que tout le monde se fait une représentation plus ou moins correcte de l ADN.
Pour être sur que tout le monde comprenne bien, voici le modèle de l ADN couramment admis :


C est bien beau me direz vous, mais qu est ce que cela représente au juste ? Pour faire simple, on remarque qu il s agit d une double hélice sur laquelle est fixée des nucléotides (A, C, G, T). Ces nucléotides s associent toujours de la manière suivante : A avec T, C avec G. L ordre de ces nucléotides a une grande importance : en effet, l ADN va subir une transcription et une traduction, que je n aborderais pas en détail ici, le but de cet article étant simplement de vous apprendre a comprendre la transmission des gènes, et non de faire de vous des généticiens. Bref, ces étapes sont tout de même importantes ici, car la double hélice d ADN va être coupée en deux au niveaux des liens entre les nucléotides, puis va être traduit afin de former des protéines. Chaque séquence codante de nucléotides (car il y a des séquences qui ne codent pas pour la formation de protéines) est appelée un gène.
Sachez également que les cellules reproductrices, a savoir les spermatozoïdes chez les males, et les ovules chez les femelles, ne possèdent qu un seul brin d ADN et ne contiennent, par conséquent, que la moitié de l information génétique de l individu.

Il arrive que différentes séquences de nucléotides codent pour le même gène, dans ce cas, on parle d allèle. On peu également considérer un allèle comme étant une partie du brin d ADN.

L ensemble des gènes est appelé génotype, et n’est pas visible a l oeuil nu. Cependant, les gènes en question ont une influence directe sur l aspect extérieur de l individus : l ensemble des différents traits observables est appelé phénotype.

D’après ces notions de phénotype et de génotype, vous aurez vite compris que l ensemble des gènes d un individu n influence pas son aspect extérieur ! Le fait de comprendre que certains gènes peuvent ne pas influencer les caractères visibles sur un individu est très important pour la suite.

En effet, lors de la fécondation, une cellule reproductrice male va fusionner avec une cellule reproductrice femelle. L information génétique qu ils contiennent va donc être assemblée, le jeune embryon porte donc 50% des gènes de son père, et 50% des gènes de sa mère.

Mais comment se faire une idée du phénotype et du génotype de l individu a naitre ?


Récessif, dominant, co-dominant… Le vif du sujet !

C est maintenant que je vais introduire ces notions essentielles, qui sont indispensables pour calculer le pourcentage de chaque phase qui va naitre. Pour que tout soit bien clair, je vais utiliser les tableaux représentant les différents croisements. Il est également possible d utiliser les tableaux de Mendel, mais la désolé, je suis parfaitement incapable de les faire… Je n ai jamais compris ces tableau, ce qui ne m a pas empeché de réussir tous les exercices de génétique présents dans mon cours de rhéto, même les plus complexe, et ce, beaucoup plus rapidement et avec plus de précisions que les autres élèves, je pense donc que l on pourra s en passer…

Commençons par le trait récessif.

De facon simplifiée, il faut que deux allèles soient présents chez l individu pour que ce trait soit exprimé. Lorsque deux allèles sont présents dans le génotype, on dit que l allèle est présent sous forme homozygote, si seul un allèle est présent, on dit que l allèle est présent sous forme hétérozygote.
Dans le cas d un trait récessif donc, seul la forme homozygote sera observable sur le phénotype.

Ensuite, le trait dominant :

Qu il soit présent sous forme hétérozygote ou homozygote, ce trait sera visible sur le phénotype.

Finalement, le trait co-dominant :

Ce trait se transmet de façon identique au trait dominant, a une exception près : il est clairement exprimé sur le phénotype sous sa forme homozygote, mais sous la forme hétérozygote, il est tout a fait différent. En effet, il s agit d un « mélange » entre le phénotype du gene dominant et du gène co-dominant présent.


Les tableaux :




* Je tiens à remercier notre Nicolas national qui sans lui ce post n'aurais pu ce faire et Valko pour en avoir eu l'idée...
** Ceci est un post ou ne sera toléré aucun flood mais n'hésitez pas à rajouter vos propres commentaires, tableaux, etc..

Pogonas vitticeps

Hypo

"Hypo" est l'abréviation de "hypomélanique". Comme le suggère cette dénomination, il s'agit d un animal présentant une réduction des marquages foncés ("hypo" signifie "moins", et "mélanique", de "mélanine", fait référence au pigment). Il y a donc une production de mélanine, seul son transport n est pas correctement effectué, c est pourquoi cette phase est plus claire qu un pogona classique. Certains pogona sont plus clair que la normale, sans pour autant être des hypo. La différence réside dans le fait que chez les vrais hypo, cette coloration est due a une erreur génétique se transmettant de génération en génération, ce qui n est pas le cas chez les autres. Les génotypes (ensemble des gènes) des deux individus est donc différent, alors que leur phénotype (apparence extérieure) est semblable.

Mais qu'est ce qu un véritable hypo? Ils sont reconnaissables a leurs ongles blancs. Si les ongles de chaque doigt sont entièrement blanc, il est certain que l animal est un véritable hypo. Si par contre un ou plusieurs ongles sont noirs, dans ce cas, il s agit d un "simple" pogona plus clair que la normale. Outre les ongles, les hypo ont également des épaules plus claires. Elles sont noire chez les spécimens classiques, alors qu elles sont bleu-gris chez les hypo.
En fait, l hypomélanisme est du a un problème lors de la synthèse de la mélanine ou de son transport vers les mélanophores, les cellules pigmentaires. L appellation hypo doit donc être réservée a ces individus issus de l élevage sélectif et portant ce caractère récessif.

Un pogona peut également porter le gène hypo sous sa forme hétérozygote, ce qui est abrégé "het. hypo". Cela signifie que l animal est porteur du gène hypo, mais ressemble a un individu normal. Il n a en effet ni les ongles blancs, ne les épaules plus claires. La raison pour laquelle ces animaux sont intéressant est que les individus hypo eux mêmes, ainsi que les individus het. hypo, sont plus clair que les individus normaux, ce qui permet de mieux faire ressortir leurs couleurs.
De plus, si l'on croise un hypo et un het. hypo, on obtient un certain pourcentage d hypo, le reste étant het. hypo.



Translucent

Encore une fois, ces animaux sont atteint d une erreur génétique. Ils se distinguent des animaux normaux par la présence de zones cutanées transparentes. Cela se remarque principalement sur les individus juvéniles, la peau s épaississant avec l age, cela est moins flagrants, mais toujours observables, chez les adultes. Cette apparence est due a l absence du pigment blanc. L absence d "iridophores" (traduction a vérifier de "iridoforen"), cellules réfléchissants la lumière et de leucophores, cellules blanches, provoque cette apparence translucide.

Hypotrans

Certains éleveurs ont réussi a obtenir des hypotrans, c est a dire des animaux exprimant a la fois le gene hypo et le gene translucent.



Leatherback & silkback

Le leatherback est une erreur génétique. Le dos d un pogona leatherback a la texture du cuir, d ou son appellation ("leather" signifie "cuir" en anglais). Il existe deux types de leatherback: le premier est du a un gène co-dominant, le second a un gène récessif.

Gène co-dominant

Le leatherback du a un gène co-dominant est le plus simple a expliquer. Il faut un leatherback pour transmettre le gène. Ainsi, lorsque l on croise un pogona leatherback avec un pogona normal, la descendance est composée de 50% de leatherback et de 50% de normaux. Si l on croise deux leatherback, on obtient un certain pourcentage de silckback, la super-forme du gène leatherback. La peau du silckback est soyeuse et ressemble a celle d un rosé (bébé souris). On peut donc considérer qu un leatherback est en quelques sortes un het silckback.
Ce tableaux apportera quelques précisions, encore une fois, les chiffres sont basés sur la théorie et peuvent différer des pourcentages réellement obtenus.



Il est probable qu en croisant un silckback et un leatherback, on obtienne 50% de silckback et 50% de leatherback. Ce n est qu une hypothese, on ne sait, a l heure actuelle, rien a ce sujet.

La génétique des phases chez Eublepharis macularius

Avant propos

Avant d’entrer dans le vif du sujet, je tiens a préciser quelques petites choses. Tout d’abord, je pense qu’il est utile de s’attaquer aux divers problèmes étiques que posent les phases, je reprendrais ici les principaux problèmes sujets a débats.

Notons que le genre Eublepharis est représenté par quelques espèces très proches, tant sur le plan morphologique que génétique. La taxonomie de ces espèces et sous espèces est d ailleurs sujettes a débat au sein de la communauté scientifique, ce qui implique des changements réguliers. Nous feront ici abstraction de Eublepharis hardwickii, espèce réservée a de rares terrariophiles, dont les différences avec les autres espèces du genre sont clairement marquées.

Bref, autant dire que la distinction des différentes espèces n est pas aisée, la taxonomie étant basée sur certaines écailles et le nombre de lamelles sous digitale.

Ainsi, quand l élevage de cette espèce a commencé, ces différentes espèces et sous-espèces ont été reproduites entre elles, par ignorance ou par souhait de sélectionner des individus au couleurs différentes de celles de l holotype, les souches d élevages telles que nous les connaissons (je parle ici de la « souche principale », celles que nous rencontrons sur toutes les bourses et présentant une multitude de phases, et non des souches pures qui commencent a refaire surface) ne constituent plus un taxon pure, mais bien un ensemble d intergrades.

Au vu des récentes modifications dans la taxonomie (certaines sous espèces ont été élevées au rang d especes), on peut considérer que parler de « Eublepharis macularius » est un abus de langage.
Ensuite, nous avons également pu remarquer les récentes dérives produites par ces fameuses phases, avec l exemple du gène enigma, lié a un syndrome du même nom, causant des troubles neurologiques irréversibles chez les animaux atteint, menant généralement a une mort prématurée.

Cette phase est en cours de régression dans les élevages, a croire qu elle n est plus assez rentable pour ceux qui ont cru bon de la reproduire en masse et de la revendre a des prix exorbitants, en prétendant « travailler sur le syndrome de l enigma pour en réduire les symptômes », et affirmant, pour certains, que « de nettes améliorations étaient observables dans leurs élevages », information totalement fausse pour leurrer l amateur non averti.

Finalement, de nombreux animaux sont reproduit de manière consanguine de façon a conserver, ou a produire plus rapidement les dites phases, ce qui entraine diverses malformations, il sera donc bon, quel que soit la phase, de se renseigner sur les pratiques de l éleveur chez qui on se procurera l animal. Vous l aurez compris, ce texte a pour but de vous donner les bases sur les phases de des geckos léopards, mais en aucun cas d en faire l apologie.

Les traits sélectionnés

Les premières phases apparues dans les élevages sont de simples variations du phénotype des animaux, par sélection, température d incubation et autres. Ces différentes phases se trouvent, pour la plupart et dans une certaine mesure, en milieu naturel. On peut citer par exemple :

-classique:
C est pour ainsi dire la “phase” la plus souvent rencontrée en milieu naturel. La couleur de fond est jaune sale, l individu présente des zones mauves et des taches noires. (ATTENTION : le « classique » constitue également un trait récessif, voir fin de l article !)

-high yellow :
Très commun en élevage, souvent revendu par abus comme « classique », la différence réside dans le jaune, nettement plus marqué chez les high yellow.

-golden :
Encore une fois on touche a la couleur jaune. Il existe deux types de geckos considérés comme golden : chez les premiers, la couleur jaune est quasiment dorée, chez les seconds, il s agit d un high yellow dont le jaune est vraiment très prononcé.

-tangerine :
La différence avec un « classique » réside dans le fait que le jaune doit cette fois ci être orange.

-hypo :
Il s agit d une réduction de marquage, on parle toujours d’hypo-quelque chose (hypo yellow, hypo tangerine…). Il existe deux types de geckos considérés comme hypo : Chez les premiers, le marquage noir est fortement réduit, et seule les bandes mauves portent des taches. Chez les seconds, le corps est ponctué de noir comme chez un classique, mais c est le mauve qui a disparu.

-super hypo :
Comme chez les hypo, il est toujours suivi d un autre terme. Il s agit ici d un gecko ne présentant ni mauve, ni taches noires.

-ghost :
Cette fois, la couleur de fond n est plus jaune, mais généralement beige. Cela donne l impression que l animal prépare constamment une mue.

-snow :
comme le ghost, ce gecko est très pale, sa couleur de fond doit être blanche.

-black :
Cette phase est très sombre, l animal possède en effet énormément de points noirs, et donc demélanine.

-jungle (designer) :
La couleur de fond n importe pas, la disposition des taches et zones mauve est atypique.

-stripped :
Il s agit d un jungle particulier, ici, une bande dorsale est complètement dépourvue de taches.

-reverse stripped :
Jungle particulier encore une fois, seule une bande dorsale comporte des taches.

-carrot tail :
Au moins 50% de la queue est orange

-carrot head :
Le marquage de la tête est orange

-baldi :
Pas de marquages sur la tete

-Bandit :
une marque noire traverse le nez… Bref, c est plus commercial qu'autre chose…

-Four eyes :
Les taches de la tête forment des « yeux »

Les traits récessifs

Il s agit de phases dues a des gènes récessifs (voir le paragraphe traitant du sujet dans le texte traitant de la génétique en général). Les animaux présentant le gène sous sa forme hétérozygote ne l expriment pas, il n est visible que chez les animaux présentant le gène sous forme homozygote.

On peut citer :

-Albinos souche Tremper :
Plus clair qu un classique, ses yeux sons gris clair.

-Albinos souche Rainwater :
Très proche du Tremper, il semble cependant être légèrement plus pale.

-Albinos souche Bell:
Cette fois, le gecko est plus pale que le Tremper, et ses yeux sont roses.

-Murphy paternless:
Sa couleur est uniforme et varie du gris au vert kaki, il s agit de ce qui est appellé par abus de langage un “leucistique”

-Blizzard:
Gecko parfaitement blanc.

Les traits co-dominants:

Chez les em, il existe deux traits co-dominants. Je vais donc décrire la forme hétérozygote et homozygote.

-Mach snow et Super Mach snow.
Il s agit respectivement de la forme heterozygote et homozygote du gène. Chez le premier, le marquage est nettement observable chez les juvéniles, alors que les adules ressemblent a des classiques. Chez la forme homozygote, le gecko a une couleur de fond blanche.

-Giant et Super Giant :
Il s agit respectivement de la forme heterozygote et homozygote du gène. Chez le premier, le gecko est généralement plus grand et lourd que la normale, ce qui est encore plus marqué chez la forme homozygote, ces geckos sont tout simplement énormes.

Les traits dominants:
Encore une fois, deux traits dominants sont connus :

-Classique :
Voir description dans « traits sélectionnés ».

-Enigma :
L enigma est un gecko a la robe tout a fait atypique. Il s est avéré qu un nouveau gène dominant occasionnait une multitude de nouveaux combo, mais ce gène entraine par ailleurs des troubles graves et irréversibles.

Les combo :
Il s agit ici des combinaisons de gène, qui ont fait la célébrité de l em. Pour citer quelques exemples :

-RAPTOr : red eye albinos patternless tremper orange
-APTOr: albinos patternless tremper orange
-Radar: l equivalent du RAPTOr, mais avec la souche Bell
-Blazzing Blizard : blizard albinos
-Bannana blizard : blizard patternless
-Bannana blazing blizzard
-Dalmatien: mach snow enigma
-Sunglow: Super hypo tangerine albinos
-Creamsicle: super hypo tangerine mach snow
-Diablo RAPTOr blizzard
-Hybino: hypo tangerine albinos
-Snowglow: mach snow sunglow

Et des centaines d autres, imaginez tout ce qui est faisable avec les gènes connus!

Les nouveautés et gènes mal connus :
Les mutations des yeux, les phases extrêmement rares a l heure actuelle, celles qui ne rencontrent pas le succès en Europe… Tant phases méconnues !

-ruby eye ou red eye : oeuil parfaitement rouge
-Snake eye : décoloration partielle de l œil
-Eclipse eye
-Abynissian : aspect proche de l albinisme, il a cependant une couleur verdatre inhabituelle. Les veines des yeux sont rouges.
-Black pearl
-Black hole
-Black velvet
-Bold stripped
-Gem snow
-Midnight blizzard: blizzard noir

Les fake :

Afin de faire de l argent, certains n ont pas hésité a photoshopper leurs photos, en tentant de présenter une nouvelle phase, ou de montrer des animaux non viables…

Les principaux cas connus les fameux geckos bleus :

Blue spot project : l animal en question était en fait nécrosé, d ou la couleur bleue au niveau de sa queue…

Blue project : les fameux geckos a ventre bleus… animaux morts peu de temps apres leurs naissances, dont on ne parle bizarrement plus…

Notes diverses :

Note sur les albinos: Il existe, a l heure actuelle, 3 souches d albinisme (les fameux “abynissians” n étant disponibles que sur le marché américain en très petite quantité et le gène étant encore très mal connu, personne ne sait s il s agit d une forme d albinisme ou pas).

Ces 3 souches sont bel et bien a considérer comme des gènes a part, elles sont incompatibles entre elles : si un gecko peut porter deux gènes albinos différents sous forme hétérozygote, c est impossible sous forme homozygote !

Les différences reposent sur le moment de neutralisation de la mélanine lors des différentes étapes de réplications, transcriptions, traductions, … de l ADN.

Note sur le classique :

La plupart des phases reprises dans le premier point sont apparentées au classique, gène dominant, dont les différents phénotypes ne sont que des couleurs sélectionnées !

La description des phases est succincte, mais je pense que taper le nom sur google vous aidera pas mal ...


* Merci à Nicolas pour son aide bien précieuse.